2024年北京市结核分枝杆菌基因型与耐药性研究

doi:10.19982/j.issn.1000-6621.20250450

中国防痨杂志 ›› 2026, Vol. 48 ›› Issue (4): 477-484.doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20250450

2024年北京市结核分枝杆菌基因型与耐药性研究

缪鸿豪¹^,², 张洁², 庞梦迪², 任怡宣², 邓阳², 易俊莉², 樊瑞芳², 陈双双², 陈昊², 于兰², 李洁¹^,²^,³(), 李传友¹^,²^,³(), 杨新宇¹^,²^,³()

¹ 首都医科大学公共卫生学院，北京 100038
² 北京市疾病预防控制中心结核病实验室，北京 100013
³ 结核病防治关键技术北京市重点实验室，北京 100035

收稿日期:2025-11-12 出版日期:2026-04-10 发布日期:2026-04-02
通信作者: 杨新宇，Email：yangxinyu@bjcdc.org；李传友，Email：lichuanyou@ccmu.edu.cn；李洁，Email：lijie304304@163.com
基金资助:
首都卫生发展科研专项(首发2024-2G-30114)

Genotypic and drug resistance of Mycobacterium tuberculosis in Beijing，2024

Miao Honghao¹^,², Zhang Jie², Pang Mengdi², Ren Yixuan², Deng Yang², Yi Junli², Fan Ruifang², Chen Shuangshuang², Chen Hao², Yu Lan², Li Jie¹^,²^,³(), Li Chuanyou¹^,²^,³(), Yang Xinyu¹^,²^,³()

¹ School of Public Health，Capital Medical University，Beijing 100038，China
² Tuberculosis Laboratory，Beijing Center for Disease Prevention and Control，Beijing 100013，China
³ Beijing Key Laboratory for Key Technologies in Tuberculosis Prevention and Control，Beijing 100035，China

Received:2025-11-12 Online:2026-04-10 Published:2026-04-02
Contact: Yang Xinyu，Email：yangxinyu@bjcdc.org；Li Chuanyou，Email：lichuanyou@ccmu.edu.cn；Li Jie，Email：lijie304304@163.com
Supported by:
Fund Capital’s Funds for Health Improvement and Research(2024-2G-30114)

摘要/Abstract

摘要：

目的：探讨2024年北京市管理肺结核患者结核分枝杆菌临床分离株基因型、表型耐药特征及两者间相关性，为本地区结核病防控提供科学依据。方法：从北京市结核病防治服务体系中收集2024年1—12月期间符合纳入标准的923例管理肺结核患者的结核分枝杆菌临床分离株及其流行病学资料。使用PCR法进行所有菌株的菌种鉴定，通过RD105缺失基因检测法鉴定北京基因型和非北京基因型菌株，并根据NTF区完整性区分古老型和现代型北京基因型。采用分枝杆菌散布重复单元—15位点数目可变串联重复序列（MIRU-VNTR 15）进行基因分型，通过分辨指数（HGI）和总分辨指数（HGDI）评估各VNTR位点及整个分型体系的多态性及分辨力，同时观察基因型成簇情况，并使用最低抑菌浓度法进行4种一线及4种A组抗结核药物的药物敏感性试验。结果：923株菌株菌种鉴定及基因分型结果显示，结核分枝杆菌922株和非洲分枝杆菌1株；其中，结核分枝杆菌中北京基因型占90.89%（838/922），且以现代型为主[85.20%（714/838）]。MIRU-VNTR分型显示，HGDI值为0.998，其中QUB11b（HGI=0.722）和QUB26（HGI=0.639）两个位点表现出高多态性，是区分菌株的关键位点。230株结核分枝杆菌成簇菌株均为北京基因型，成簇率为24.95%（230/922），98.26%（226/230）为北京现代型；共形成63个簇，最大簇包含29株菌株，均为北京现代型。耐药检测显示，异烟肼的耐药率最高[12.26%（113/922）]，乙胺丁醇最低[0.22%（2/922）]；北京基因型对异烟肼和左氧氟沙星的耐药率[分别为12.89%（108/838）和9.79%（82/838）]均明显高于非北京型[分别为5.95%（5/84）和2.38%（2/84）]，现代型对异烟肼和利福平的耐药率[分别为11.76%（84/714）和5.18%（37/714）]均明显低于古老型[分别为19.35%（24/124）和11.29%（14/124）]，差异均有统计学意义（χ²=3.415，P=0.039；χ²=5.055，P=0.012；χ²=5.421，P=0.018；χ²=6.897，P=0.011）。结论：现代型北京基因型具有较高的遗传多样性和传播活性，是北京市结核分枝杆菌优势流行株和近期传播的主要基因型，且以异烟肼耐药问题最为突出，故需加强对现代型北京基因型菌株，特别是耐药菌株的分子监测与传播链追踪。

关键词: 分枝杆菌, 结核, 基因型, 串联重复序列, 结核, 抗多种药物性

Abstract:

Objective：To characterize the genotypic characteristics and drug resistance features of Mycobacterium tuberculosis （MTB） clinical isolates from management of pulmonary tuberculosis （PTB） patients in Beijing in 2024，as well as the correlation between them，providing scientific evidence for tuberculosis prevention and control in Beijing. Methods：A total of 923 clinical isolates of MTB and their epidemiological data were systematically collected from registered PTB patients in Beijing Tuberculosis Prevention and Care System between January and December，2024 who met the study criteria. Polymerase chain reaction （PCR） was used for species identification of all strains. The Beijing genotype and non-Beijing genotype were identified using the RD105 deletion gene detection method，and ancient and modern Beijing genotypes were distinguished according to the integrity of the NTF region. Genotyping was conducted using 15-locus Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit-Variable Number Tandem Repeat （MIRU-VNTR 15） analysis. The polymorphism and discriminatory power of each VNTR locus and the entire typing system were evaluated by the Hunter-Gaston Index （HGI） and the overall Hunter-Gaston Discriminatory Index （HGDI）. Meanwhile，the clustering of genotypes was observed，and the minimum inhibitory concentration （MIC） method was used to perform drug susceptibility testing for 4 first-line and 4 Group A anti-tuberculosis drugs. Results：Species identification and genotyping results of 923 strains showed that there were 922 strains of MTB and 1 strain of Mycobacterium africanum. Among the MTB strains，the Beijing genotype accounted for 90.89% （838/922），mainly dominated by the modern type （85.20%，714/838）. MIRU-VNTR genotyping revealed an HGDI value of 0.998，among which two loci，QUB11b （HGI=0.722） and QUB26 （HGI=0.639），exhibited high polymorphism and were key loci for distinguishing strains. All 230 clustered MTB strains were of the Beijing genotype，with a clustering rate of 24.95% （230/922），and 98.26% （226/230） of them were modern Beijing genotype. A total of 63 clusters were formed，and the largest cluster contained 29 strains，all of which were modern Beijing genotype. Drug resistance testing showed that isoniazid had the highest resistance rate （12.26% （113/922）），while ethambutol had the lowest （0.22%，2/922）. The drug resistance rates of the Beijing genotype to isoniazid and levofloxacin （12.89% （108/838） and 9.79% （82/838），respectively） were significantly higher than those of the non-Beijing genotype （5.95% （5/84） and 2.38% （2/84），respectively）. The modern type had a significantly lower drug resistantce rate to isoniazid （11.76% （84/714）） and rifampicin （5.18% （37/714）） than the ancient type （19.35% （24/124） and 11.29% （14/124）），with all differences being statistically significant （χ²=3.415，P=0.039；χ²=5.055，P=0.012；χ²=5.421，P=0.018；χ²=6.897，P=0.011）. Conclusion：The modern Beijing genotype，characterized by high genetic diversity and transmission activity，is the dominant epidemic strain and the main genotype responsible for recent transmission of MTB in Beijing，with isoniazid resistance being the most prominent problem. Therefore，it is necessary to strengthen molecular monitoring and transmission chain tracing of modern Beijing genotype strains，especially for drug-resistant strains.

Key words: Mycobacterium tuberculosis, Genotyping, Tandem repeat sequences, Tuberculosis, multidrug-resistant

中图分类号:

缪鸿豪, 张洁, 庞梦迪, 任怡宣, 邓阳, 易俊莉, 樊瑞芳, 陈双双, 陈昊, 于兰, 李洁, 李传友, 杨新宇. 2024年北京市结核分枝杆菌基因型与耐药性研究[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 477-484. doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20250450

Miao Honghao, Zhang Jie, Pang Mengdi, Ren Yixuan, Deng Yang, Yi Junli, Fan Ruifang, Chen Shuangshuang, Chen Hao, Yu Lan, Li Jie, Li Chuanyou, Yang Xinyu. Genotypic and drug resistance of Mycobacterium tuberculosis in Beijing，2024[J]. Chinese Journal of Antituberculosis, 2026, 48(4): 477-484. doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20250450

图/表 5

表1

表2

表3

表4

表5

参考文献 20

[1]	屈燕, 李涛, 马文斌, 等. 世界卫生组织《2025年全球结核病报告》解读. 结核与肺部疾病杂志, 2025, 6(6): 613-623. doi:10.19983/j.issn.2096-8493.20250178.
[2]	Munro-Rojas D, Fernandez-Morales E, Zarrabal-Meza J, et al. Genetic diversity of drug and multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis circulating in Veracruz, Mexico. PLoS One, 2018, 13(3): e0193626. doi:10.1371/journal.pone.0193626.
[3]	Garzon-Chavez D, Garcia-Bereguiain MA, Mora-Pinargote C, et al. Population structure and genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis in Ecuador. Sci Rep, 2020, 10(1): 6237. doi:10.1038/s41598-020-62824-z. pmid: 32277077
[4]	赵玉玲, 李辉, 徐吉英, 等. 河南省结核分枝杆菌北京家族基因型及耐药分析. 中国公共卫生, 2011, 27(7): 877-879. doi:10.11847/zgggws2011-27-07-27.
[5]	Mokrousov I, Ly HM, Otten T, et al. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography. Genome Res, 2005, 15(10): 1357-1364. doi:10.1101/gr.3840605. pmid: 16169923
[6]	Shamebo T, Gumi B, Zewude A, et al. Molecular epidemiology and drug sensitivity of Mycobacterium tuberculosis in homeless individuals in the Addis Ababa city, Ethiopia. Sci Rep, 2023, 13(1): 21370. doi:10.1038/s41598-023-48407-8.
[7]	World Health Organization. Guidance for the surveillance of drug resistance in tuberculosis:Sixth edition. Geneva: World Health Organization, 2022.
[8]	谢彤, 巨韩芳, 王春花, 等. 结核分枝杆菌北京基因型亚型的流行及与耐药性的关系研究. 中国防痨杂志, 2015, 37(9): 928-932. doi:10.3969/j.issn.1000-6621.2015.05.003.
[9]	梁晨, 张旭霞, 邢青, 等. 北京基因型结核分枝杆菌的流行及与二线抗结核药物耐药性的相关性. 中华结核和呼吸杂志, 2020, 43(4): 356-361. doi:10.3760/cma.j.cn112147-20191215-00827.
[10]	Zhang J, Mi L, Wang Y, et al. Genotypes and drug susceptibility of Mycobacterium tuberculosis Isolates in Shihezi, Xinjiang Province, China. BMC Res Notes, 2012, 5: 309. doi:10.1186/1756-0500-5-309. pmid: 22713520
[11]	Hanekom M, Gey Van Pittius NC, Mcevoy C, et al. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a template for success. Tuberculosis (Edinb), 2011, 91(6): 510-523. doi:10.1016/j.tube.2011.07.005.
[12]	Rufai SB, Singh J, Kumar P, et al. Association of gyrA and rrs gene mutations detected by MTBDRsl V1 on Mycobacterium tuberculosis strains of diverse genetic background from India. Sci Rep, 2018, 8(1): 9295. doi:10.1038/s41598-018-27299-z.
[13]	张国龙. 15位点重复单元-可变数目串联重复序列技术在河南地区结核分枝杆菌的基因分辨率的对比分析研究. 中国卫生检验杂志, 2020, 30(13): 1551-1555. doi:10.19812/j.cnki.jfsq11.
[14]	高媛, 雷卉, 张书, 等. 四川省农村地区222株结核分枝杆菌基因分型及耐药分析. 寄生虫病与感染性疾病, 2025, 23(1): 37-42. doi:10.19972/j.cnki.1672-2116.20250017.
[15]	王泉, 古丽比克·木拉提, 陈清波, 等. 新疆维吾尔自治区结核分枝杆菌基因型多样性及其耐药特征研究. 中国防痨杂志, 2025, 47(S1): 12-16.
[16]	李丹, 胡晓红, 徐新娟, 等. 宜昌地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的鉴定及VNTR分型. 中国感染控制杂志, 2022, 21(3): 232-238. doi:10.12138/j.issn.1671-9638.20221895.
[17]	张治国, 吴进凤, 王莉, 等. 北京市昌平地区2011—2015年结核分枝杆菌的流行特征. 中华流行病学杂志, 2017, 38(9): 1236-1240. doi:10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2017.09.019.
[18]	刘丙雨, 杨雪, 贾鹏霞, 等. 阿克苏地区耐药结核杆菌基因分型及耐药性分析. 微量元素与健康研究, 2021, 38(3): 53-56. doi:10.13481/j.1671-587x.20200842.
[19]	唐静, 王斌, 龙莹, 等. 2018—2020年四川省自贡市耐药结核分枝杆菌分子流行病学分析. 现代预防医学, 2024, 51(8): 1493-1498. doi:10.20043/j.cnki.MPM.202311202.
[20]	叶静芬, 方晴, 胡耀仁, 等. 北京基因型耐多药结核分枝杆菌二线抗结核药物耐药基因突变特征分析. 预防医学, 2021, 33(10): 983-987. doi:10.19485/j.cnki.issn2096-5087.2021.10.003.

特征	北京基因型（838株）					非北京基因型（84株）	χ²值	P值^b	合计
特征	古老型（124株）	现代型（714株）	χ²值	P值^a	合计	非北京基因型（84株）	χ²值	P值^b	合计
性别			0.024	0.476			0.003	0.530
男性	83（9.90）	483（57.64）			566（67.54）	57（67.86）			623（67.57）
女性	41（4.89）	231（27.57）			272（32.46）	27（32.14）			299（32.43）
年龄组（岁）			2.525	0.642			8.969	0.062
≤20	4（0.48）	17（2.03）			21（2.51）	2（2.38）			23（2.49）
21~40	31（3.70）	171（20.41）			202（24.11）	26（30.95）			228（24.73）
41~60	37（4.42）	189（22.55）			226（26.97）	31（36.90）			257（27.87）
61~80	36（4.29）	257（30.67）			293（34.96）	18（21.43）			311（33.73）
81~97	16（1.91）	80（9.55）			96（11.46）	7（8.33）			103（11.17）
治疗类型			0.975	0.229			0.101	0.750
初治	120（14.32）	676（80.67）			796（94.99）	81（96.43）			877（95.12）
复治	4（0.48）	38（4.53）			42（5.01）	3（3.57）			45（4.88）

药物	北京基因型（838株）					非北京基因型（84株）	χ²值	P值	合计（922株）
药物	古老型（124株）	现代型（714株）	χ²值	P值	合计	非北京基因型（84株）	χ²值	P值	合计（922株）
异烟肼	24（19.35）	84（11.76）	5.421	0.018	108（12.89）	5（5.95）	3.415	0.039	113（12.26）
利福平	14（11.29）	37（5.18）	6.897	0.011	51（6.09）	2（2.38）	1.311	0.252	53（5.75）
乙胺丁醇	0（0.00）	2（0.28）	-	0.726	2（0.24）	0（0.00）	-	0.826	2（0.22）
吡嗪酰胺	6（4.84）	28（3.92）	0.228	0.389	34（4.06）	3（3.57）	-	0.560	37（4.01）
莫西沙星	6（4.84）	46（6.44）	0.467	0.327	52（6.21）	1（1.19）	2.679	0.102	53（5.75）
左氧氟沙星	12（9.68）	70（9.80）	0.002	0.560	82（9.79）	2（2.38）	5.055	0.012	84（9.11）
贝达喹啉	2（1.61）	1（0.14）	-	0.059	3（0.36）	0（0.00）	-	0.751	3（0.33）
利奈唑胺	0（0.00）	3（0.42）	-	0.618	3（0.36）	1（1.19）	-	0.318	4（0.43）

耐药模式	初治（877株）	复治（45株）	χ²值	P值	北京基因型					非北京基因型（84株）	χ²值	P值	合计（922株）
耐药模式	初治（877株）	复治（45株）	χ²值	P值	古老型（124株）	现代型（714株）	合计（838株）	χ²值	P值	非北京基因型（84株）	χ²值	P值	合计（922株）
全敏感	705 （80.39）	29 （64.44）	1034.273	<0.001	93 （75.00）	566 （79.27）	659 （78.64）	528.299	<0.001	75 （89.29）	77.912	<0.001	734 （79.61）
利福平耐药	43 （4.90）	10 （22.22）	21.155	<0.001	14 （11.29）	37 （5.18）	51 （6.09）	10.668	<0.001	2 （2.38）	46.642	<0.001	53 （5.75）
耐多药	35 （3.99）	8 （17.78）	11.487	<0.001	13 （10.48）	28 （3.92）	41 （4.89）	5.613	0.018	2 （2.38）	36.217	<0.001	43 （4.66）

2024年北京市结核分枝杆菌基因型与耐药性研究

Genotypic and drug resistance of Mycobacterium tuberculosis in Beijing，2024

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

图/表 5

参考文献 20

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

位点	重复单元数												HGI值
位点	0	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	HGI值
ETRA	9	1	26	133	747	4	2	0	0	0	0	0	0.321
ETRC	0	0	8	16	881	16	1	0	0	0	0	0	0.085
Mtub04	14	25	108	165	548	60	2	0	0	0	0	0	0.596
Mtub21	4	31	12	88	138	599	34	9	5	2	0	0	0.543
Mtub30	0	2	100	12	799	8	0	1	0	0	0	0	0.236
Mtub39	2	26	21	796	59	18	0	0	0	0	0	0	0.248
MIRU04	0	24	12	850	23	10	0	2	1	0	0	0	0.148
MIRU10	3	16	140	680	79	3	1	0	0	0	0	0	0.425
MIRU16	8	8	64	809	26	7	0	0	0	0	0	0	0.224
MIRU26	0	10	13	5	35	78	99	567	89	17	6	3	0.591
MIRU31	1	3	24	106	229	525	30	2	2	0	0	0	0.599
MIRU40	1	30	63	769	52	7	0	0	0	0	0	0	0.295
QUB11b	12	14	18	36	112	301	357	58	11	2	0	1	0.722
QUB4156	8	28	786	76	20	3	0	0	1	0	0	0	0.264
QUB26	28	3	4	8	19	21	74	154	520	77	12	2	0.639

菌株	株数	北京型		非北京型	患者性别		患者年龄					患者治疗类型
菌株	株数	古老型	现代型	非北京型	男性	女性	≤20岁	21~40岁	41~60岁	61~80岁	≥81岁	初治	复治
成簇菌株	230	4	226	0	161	69	6	52	53	95	24	220	10
Ⅰ群	29	0	29	0	22	7	1	3	6	13	6	27	2

[1]	. 浅表淋巴结结核中西医结合诊断与治疗指南[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 429-447.
[2]	纪链容, 薛允莲, 江雪, 袁莎莎, 刘贵浩, 王小万, 邹霞, 汪婷婷, 周湛淇, 周琳. 2016—2024年广东省结核病共病住院患者时空分布与聚集特征分析[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 448-458.
[3]	刘曦, 刘瑜泽, 华伟玉, 李婕, 张颖, 董彬. 2012—2022年北京市海淀区肺结核流行特征及其与人口密度间的关联分析[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 459-467.
[4]	王勇兵, 钟粤相, 付秀英, 张盈, 温文沛, 周芳静, 杨应周, 罗济伦. 广东省英德市无结核社区试点地区三类重点人群结核分枝杆菌感染率调查及相关因素分析[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 468-476.
[5]	李静, 张阳奕, 杨景卉, 吴哲渊, 李宁迪, 郁晨蕾, 王莉莉, 沈旭辉, 江渊, 沈鑫. 上海市结核分枝杆菌利福平rpoB基因突变特征与耐药水平相关性的研究[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 485-494.
[6]	钟国伟, 张少毅, 范会玲. 血清LncRNA LINC00707、miR-382-5p在肺结核患者中的表达及其临床价值[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 495-503.
[7]	江丽娜, 戴文汐, 巨韩芳, 孟苏凯, 王春花. 金胺O荧光染色全自动显微扫描识别系统在结核病诊断中的应用价值[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 504-509.
[8]	韩延卓, 鹿振辉, 苏奔, 周睿, 陈佳骏, 吴显伟, 吴定中, 张少言, 邱磊. 结核后支气管扩张症的临床特征分析[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 510-517.
[9]	高先茹, 崔文娟, 张盟冉, 杨恪凡, 郝慧元, 杨璐, 孙文文. 15例初治肺结核患者健康管理旅程地图的研究[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 518-524.
[10]	杨洁, 董宁, 魏潇雯, 吴艳, 董文芳, 吴元浩, 张林. 基于健康行动过程取向理论的家属参与式健康教育对老年肺结核患者服药依从性和肺功能的影响[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 525-533.
[11]	杜芳芳, 曹雪芳, 王瑾, 金奇, 刘剑君, 高磊, 成诗明. 中国防痨协会团体标准研制现状分析[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 534-540.
[12]	周文斯, 郭萌, 陈清波, 王泉, 李维. 2004—2025年耐多药结核病研究的中英文文献发表情况对比分析[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 541-549.
[13]	邱玉贤, 黄芳, 杨小艺, 杨峰, 鲁华, 张天怡, 张杨, 姚蓉, 李园园. 数字孪生技术在结核病患者管理中的研究进展[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 550-555.
[14]	李翔, 赵衡, 付旭文, 寸新华. 儿童膝关节结核累及生长板一例[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(4): 556-559.
[15]	舒薇, 刘宇红. 世界卫生组织《2025年全球结核病报告》结核病科学研究章节解读[J]. 中国防痨杂志, 2026, 48(3): 307-312.