中国防痨杂志 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (4): 354-361.doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20210573
田丽, 周伟, 黄星, 吴显伟, 张惠勇, 鹿振辉, 张少言()
收稿日期:
2021-09-26
出版日期:
2022-04-10
发布日期:
2022-04-06
通信作者:
张少言
E-mail:zhangshaoyan000@163.com
基金资助:
TIAN Li, ZHOU Wei, HUANG Xing, WU Xian-wei, ZHANG Hui-yong, LU Zhen-hui, ZHANG Shao-yan()
Received:
2021-09-26
Online:
2022-04-10
Published:
2022-04-06
Contact:
ZHANG Shao-yan
E-mail:zhangshaoyan000@163.com
Supported by:
摘要:
目的: 明确中国异烟肼(INH)耐药结核分枝杆菌基因突变的分子特征。方法: 在PubMed、中国知网、万方、维普数据库中检索有关中国结核分枝杆菌耐INH基因突变的研究文献,对纳入文献的突变基因的突变位点、突变类型,以及氨基酸改变数量等信息进行整合分析。结果: 共纳入69篇中英文文献,共6393株INH耐药结核分枝杆菌。95.71%(6119/6393)检测到基因突变或缺失,其中katG、inhA、aphC突变数量最多,分别占77.57%(4959/6393)、15.20%(972/6393)、3.69%(236/6393)。单基因单位点突变占87.80%(5613/6393),联合突变占12.20%(780/6393)。katG315突变占INH耐药菌株总数的56.22%(3594/6393),katG463突变占10.03%(641/6393),inhA15突变占10.10%(646/6393)。突变形式最常见的是C→T,占10.03%(641/6393)。结论:中国INH耐药结核分枝杆菌突变基因最多的是katG、inhA、ahpC,突变密码子最多的是katG315、katG463、inhA15。
中图分类号:
田丽, 周伟, 黄星, 吴显伟, 张惠勇, 鹿振辉, 张少言. 中国异烟肼耐药结核分枝杆菌基因突变特征分析[J]. 中国防痨杂志, 2022, 44(4): 354-361. doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20210573
TIAN Li, ZHOU Wei, HUANG Xing, WU Xian-wei, ZHANG Hui-yong, LU Zhen-hui, ZHANG Shao-yan. Analysis of gene mutation characteristics of isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis in China[J]. Chinese Journal of Antituberculosis, 2022, 44(4): 354-361. doi: 10.19982/j.issn.1000-6621.20210573
表1
纳入文献菌株信息
菌株来源 | 数量(株) | 菌株来源 | 数量(株) | 菌株来源 | 数量(株) |
---|---|---|---|---|---|
江苏南京[ | 59 | 福建e[ | 75 | 陕西西安[ | 139 |
江苏苏州[ | 42 | 福建f[ | 67 | 山西长治等[ | 92 |
湖北宜昌[ | 2271 | 福建福州g[ | 999 | 河南[ | 115 |
湖北武汉[ | 69 | 福建福州h[ | 352 | 河北石家庄[ | 76 |
浙江[ | 120 | 福建龙岩[ | 411 | 河北[ | 1017 |
浙江[ | 110 | 海南[ | 94 | 北京[ | 128 |
浙江宁波[ | 455 | 湖南长沙[ | 1031 | 北京[ | 153 |
浙江杭州[ | 53 | 重庆[ | 208 | 北京[ | 121 |
浙东地区[ | 1064 | 深圳[ | 151 | 北京[ | 4584 |
江浙地区[ | 399 | 深圳i[ | 136 | 北京怀柔[ | 235 |
安徽[ | 114 | 深圳j[ | 83 | 天津[ | 822 |
安徽[ | 114 | 深圳k[ | 303 | 天津[ | 139 |
安徽[ | 80 | 广西百色[ | 98 | 山东[ | 265 |
安徽合肥a[ | 108 | 江西南昌[ | 77 | 长春[ | 671 |
安徽合肥b[ | 86 | 广东[ | 160 | 青海[ | 198 |
安徽合肥c[ | 80 | 广州[ | 206 | 西藏[ | 413 |
安徽六安[ | 65 | 江西[ | 1447 | 新疆[ | 99 |
贵州贵阳[ | 31 | 上海[ | 322 | 乌鲁木齐[ | 273 |
贵州遵义[ | 127 | 香港[ | 30 | 华东地区[ | 429 |
贵州遵义[ | 87 | 台湾[ | 324 | 3省l[ | 144 |
四川[ | 173 | 吉林[ | 370 | 11省(市、自治区)m[ | 183 |
四川绵阳[ | 586 | 陕西[ | 518 | 5省n[ | 137 |
福建d[ | 61 | 陕西[ | 124 | 23省(市、自治区)o[ | 257 |
表3
不同地区INH耐药基因突变情况
地区 | 菌株数 (株) | 构成比 (%) | 耐INH | 构成比 (%) | katG基因 | 构成比 (%) | inhA基因 | 构成比 (%) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
中部 | 5657 | 22.97 | 1107 | 17.32 | 863 | 17.40 | 332 | 34.16 |
东部 | 6475 | 26.30 | 2254 | 35.26 | 1860 | 37.51 | 345 | 35.50 |
西部 | 1380 | 5.60 | 481 | 7.52 | 334 | 6.74 | 50 | 5.14 |
南部 | 373 | 1.51 | 128 | 2.00 | 75 | 1.51 | 19 | 1.95 |
北部 | 9932 | 40.32 | 1910 | 29.88 | 1394 | 28.11 | 143 | 14.71 |
未分区a | 813 | 3.30 | 513 | 8.02 | 433 | 8.43 | 83 | 8.54 |
合计 | 24630 | 100.00 | 6393 | 100.00 | 4959 | 100.00 | 972 | 100.00 |
表4
6393株INH耐药菌株基因突变情况
突变基因 | 密码子 | 氨基酸改变 | 菌株数(株) | 突变基因 | 密码子 | 氨基酸改变 | 菌株数(株) |
---|---|---|---|---|---|---|---|
katG | 315 | - | - | inhA | 15 | - | - |
katG | AGC→ACC | Ser→Thr | 1449 | inhA | C→T | - | 641 |
katG | AGC→ACC | Ser→Trp | 3 | inhA | 未明确 | - | 5 |
katG | AGC→ACC | 未明确 | 602 | inhA | 8 | - | 28 |
katG | AGC→AAC | Ser→Asn | 125 | inhA | 17 | - | 1 |
katG | AGC→AAC | Gly→Asn | 7 | inhA | 18 | - | 3 |
katG | AGC→AAC | 未明确 | 42 | ahpC | 10 | - | 22 |
katG | AGC→ACA | Ser→Thr | 9 | ahpC | 9 | - | 9 |
katG | AGC→ACA | Ser→Trp | 1 | ahpC | 6 | - | 9 |
katG | AGC→ACA | Gly→Thr | 1 | ahpC | 39 | - | 9 |
katG | AGC→ATC | Ser→Lie | 6 | ahpC | 93 | - | 5 |
katG | AGC→GGC | Ser→Gly | 3 | ahpC | 32 | - | 2 |
katG | AGC→GGC | Gly→Gly | 1 | ahpC | 其他c | - | 138 |
katG | AGC→ACG | Ser→Thr | 3 | kasA | 312 | - | 2 |
katG | 未明确 | Ser→Thr | 743 | kasA | 121 | - | 2 |
katG | 未明确 | Ser→Asn | 150 | kasA | 387 | - | 3 |
katG | 未明确 | Ser→Met | 120 | kasA | 413 | - | 1 |
katG | 未明确 | Ser→Arg | 1 | kasA | 66 | - | 4 |
katG | 缺失 | - | 13 | kasA | 17 | - | 1 |
katG | 其他a | - | 315 | kasA | 30 | - | 1 |
katG | 463 | - | - | kasA | 80 | - | 1 |
katG | CGG→CTG | Arg→Leu | 384 | kasA | 130 | - | 1 |
katG | CGG→TGG | - | 2 | kasA | 未明确 | - | 29 |
katG | 未明确 | - | 255 | kasA | 缺失 | - | 6 |
katG | 65 | - | - | ndh | - | - | 18 |
katG | GCC→GAC | A→D | 1 | efpA | - | - | 3 |
katG | 101 | iniA | - | - | 5 | ||
katG | CTG→CTA | L→L | 1 | iniB | - | - | 32 |
katG | 123 | iniC | - | - | 8 | ||
katG | GGG→AGG | G→R | 1 | katG+katGd | - | - | 318 |
katG | 141 | - | - | katG+inhA | - | - | 294 |
katG | TTG→CTC | L→V | 1 | katG+ahpC | - | - | 42 |
katG | 234 | - | - | 其他组合e | - | - | 126 |
katG | GCG-GGG | - | 1 | 其他f | - | - | 319 |
katG | 其他b | - | 65 |
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