靶标 | 推荐鉴定菌种 | 缺陷 | 备注 | 16S rRNA | 鉴定临床常见非结核分枝杆菌,如鸟分枝杆菌复合群、脓肿分枝杆菌复合群、偶发分枝杆菌复合群等,以及戈登分枝杆菌、蟾蜍分枝杆菌、玛尔摩分枝杆菌、瘰疬分枝杆菌、草分枝杆菌、耻垢分枝杆菌 | 不能区分堪萨斯和胃分枝杆菌、海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌和脓肿分枝杆菌,对鸟分枝杆菌复合群、脓肿分枝杆菌复合群、偶发分枝杆菌复合群亚种的鉴定能力弱 | 现有数据库最完整 | hsp65 | 常见非结核分枝杆菌的鉴定,如鸟分枝杆菌复合群和脓肿分枝杆菌复合群及亚种,堪萨斯分枝杆菌、胃分枝杆菌、海分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌、瘰疬分枝杆菌、耻垢分枝杆菌、草分枝杆菌等 | 对偶发分枝杆菌复合群亚种和猿分枝杆菌的鉴定能力弱 | 鉴别能力优于其他靶标 | rpoB | 常见非结核分枝杆菌的鉴定,如脓肿分枝杆菌复合群及亚种,鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌、龟分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、胃分枝杆菌、海分枝杆菌、溃疡分枝杆菌等 | 对土分枝杆菌的鉴定能力弱 | 同时检测利福平耐药性 | ITS | 常见缓慢生长型分枝杆菌的鉴定,如鸟分枝杆菌复合群及亚种,胃分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、瘰疬分枝杆菌、戈登分枝杆菌、玛尔摩分枝杆菌和苏尔佳分枝杆菌 | 对快速生长型分枝杆菌鉴定能力弱 | 通常作为16S rRNA的补充 |
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