结核分枝杆菌cfDNA在结核病诊断中的发展现状和挑战
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彭利君, 方婷婷, 蔡龙
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Development and challenges of Mycobacterium tuberculosis cfDNA in the diagnosis of tuberculosis
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Peng Lijun, Fang Tingting, Cai Long
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表1 国内外结核分枝杆菌cfDNA诊断结核病的性能评估
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| 第一作者 | 样本类型 | 确诊方法 | 靶标 | 检测方法 | 产物大小
(bp) | 涂片阳性
(%) | 敏感度
(%) | 特异度
(%) | | Ushio[28] | 血浆 | 培养 | IS6110
gyrB | dPCR | 137 | 100 | 65(21/33)
29(10/33) | 93(18/19)
100(19/19) | | Yan | 全血 | 综合诊断 | IS6110 | dPCR
qPCR | 83 | - | 100(28/28)
50(14/28) | 100(28/28)
100(28/28) | | Yan | 全血 | 综合诊断 | IS6110 | dPCR
qPCR | 83 | - | 100(28/28)
54(15/28) | 100(28/28)
100(28/28) | | Click[30] | 血浆 | 培养、Xpert | IS6110 | qPCR | 106 | 100 | 45(18/40) | 2/3 | | 韩冰[31] | 血浆 | 涂片、培养 | IS6110 | qPCR | - | - | 79.70(94/118) | 95(58/61) | | Lyu[34] | 血浆 | 涂片、培养 | IS6110
IS1081 | dPCR | 71
71 | - | 40.6(63/155)
27.1(42/155) | 93.4(99/106)
93.4(99/106) | | Pan[33] | 血浆 | 培养、病理和分子 | IS6110 | qPCR | 71 | 45.8 | 54.2(13/24) | 96.5(55/57) | | Park[32] | 血浆 | 培养、分子 | IS6110 | PCR | - | 31.6 | 80.0(32/40)c
47.5(19/40)d | 78.1(32/41)
85.4(35/41) | | Cannas[39] | 尿液 | 涂片、培养 | IS6110 | 半巢式PCR | 67/129 | 95 | 79(34/43) | 100(23/23) | | Labugger[43] | 尿液 | 培养 | IS6110 | PCR | 38 | 60 | 64(7/11) | 8/8 | | Patel[42] | 尿液 | 培养 | DR区 | PCR | 38 | 33 | 43(75/175) | 89(210/237) | | Oreskovic[41] | 尿液 | Xpert | IS6110 | PCR | 40 | 38.8 | 83.7(41/49) | 100(24/24) | | Che[20] | 胸腔积液 | 综合诊断 | IS6110 | qPCR | - | - | 75(45/60) | 100(18/18) | | 寿娟[21] | 胸腔积液 | 综合诊断 | IS6110 | qPCR | - | 12.0 | 63(65/103) | 100(33/33) | | Yang[22] | 胸腔积液 | 综合诊断 | IS6110 | qPCR | - | - | 69.23(153/221) | 100(65/65) | | Sharma[23] | 腹腔积液 | 综合诊断 | devR | qPCR | 139 | - | 70.9(22/31) | 97.1(33/34) | | Haldar[24] | 脑脊液 | 培养 | IS6110
devR | PCR
qPCR | 200
144 | - | 85.2(69/81)
87.6(71/81) | 92(72/86)
92(79/86) | | Haldar[25] | 脑脊液 | 培养 | devR | qPCR | 144 | - | 100(29/29) | 96(125/130) | | Shao[26] | 脑脊液 | 综合诊断 | IS6110 | qPCR | 75 | - | 53.3(32/60) | 100(24/24) | | Li[27] | 脑脊液 | 综合诊断 | IS6110 | qPCR | - | - | 56.5(26/46) | 100(22/22) |
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